Pirmais krievu cars, kurš nav no Ruriku ģimenes, Boriss Godunovs nomira 53 gadu vecumā 1605. gada 13. aprīlī. Viņa nāve ir ietverta noslēpumos, un līdz šai dienai vēsturnieki strīdas par to, vai viņa nāve bija dabiska vai vardarbīga.
Hronikas dokumenti norāda, ka nāves dienā Godunovs izskatījās vesels, pusdienoja ar lielu apetīti un uzkāpa tornī, no kura mīlēja apsekot Maskavu. Tad viņš nogāja no viņas, jutoties slikti. Pie cara izsauktais ārsts neko nevarēja izdarīt, cars asiņoja no ausīm un deguna, drīz vien Godunova vairs nebija.
Kā rakstīja viens no Anglijas vēstnieka Tomasa Smita pārstāvjiem, kurš tajā brīdī atradās Krievijas autokrāta galmā, cars jutās papildus nelabumam un sāpēm vēderā, un nomira pirms ārsta ierašanās.
Borisa Godunova pēkšņā nāve, sāpes vēderā dod pamatu aizdomām par cara saindēšanos. Viņa nāve, pirmkārt, bija izdevīga Viltus Dmitrija I piekritējiem, kuru karaspēks tajā laikā tuvojās Maskavai.
Tautas vidū bija arī baumas, ka pats cars tika saindēts izmisuma lēkmē, ko izraisīja viņa nepopulārs ļaužu vidū, bads valstī un poļu okupācija.
Zinot Borisa temperamentu, raksturu, tieksmi pēc augstākās varas, kurai viņš bija gatavs uz visu (viņš tika apsūdzēts par Ivana Briesmīgā saindēšanu, Ivana IV dēla Careviča Dmitrija slepkavību), un ko viņš panāca, kļūstot par de faktiskais Krievijas valdnieks Fedora Ivanoviča vadībā, jūs varat apšaubīt Godunova pašnāvības versiju. Krievu tauta, pēc viņa domām par caru, visticamāk, bija vienaldzīga pret autokrātu. Poļu virzība uz priekšu visā valstī nevarēja nobiedēt arī caru, jo Krievijas vēsturē bija vēl sliktāki laiki, atcerēsimies, piemēram, mongoļu-tatāru iebrukumu Krievijā.
Nevajadzētu aizmirst, ka Godunovs pēdējā laikā bieži slimoja, un viņa nāve varēja būt autokrāta ilgstošas slimības rezultāts.
